FIMO生成的HTML报告默认带有40px的body边距，这是模板内联CSS硬编码的，无法通过命令行参数控制，必须手动编辑HTML或注入CSS清除；导出PDF时需同步处理HTML边距与打印设置以避免叠加偏移。
HTML输出默认带边距，且无法通过FIMO命令行直接控制
FIMO本身不提供--margin、--page-margin或类似参数，生成的HTML报告（如fimo.html）由内置模板渲染，顶部/左右默认留白约40–60px，这是CSS内联样式写死的，不是浏览器默认行为。
常见现象：打开fimo.html后发现motif hit表格离顶部很远、左右有明显空白，误以为是CSS重置没生效或浏览器缩放问题——实际是FIMO模板自带的body { margin: 40px; }。
- 该边距存在于所有FIMO版本（v5.1.1及之前主流版本均一致）
- 不随
--oc输出目录变化，也不受--verbosity影响 - 即使输入序列极短、只匹配1个位点，边距依然存在
修改边距必须手动编辑HTML或注入CSS
没有配置开关，只能事后干预。最稳妥方式是用脚本在生成后自动重写
块或插入新样式：
- 查找并替换
body { margin: 0; } - 或在
前追加： - 若用Python批量处理：
sed -i 's/body { margin: [0-9]/+px; }/body { margin: 0; }/' fimo.html（Linux/macOS）
导出PDF时边距会叠加，需额外处理
用Chrome或wkhtmltopdf转PDF时，HTML自身的body margin会和打印设置中的“页边距”（如默认1cm）叠加，导致内容严重偏移。这不是FIMO问题，但极易被忽略：
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- Chrome打印预览中勾选“背景图形”，但**不要**勾选“页眉页脚”——后者会再加一层边距
- wkhtmltopdf建议加参数：
--margin-top 0 --margin-bottom 0 --margin-left 0 --margin-right 0 --no-outline - 更可靠的做法：先用上述方法清空HTML的
body margin，再用--margin-* 0导出
FIMO的HTML输出边距是硬编码的视觉设计选择，不是bug，也无意提供接口暴露。如果自动化流程里需要精确控制版式，务必把“抹掉body margin”作为固定后处理步骤，而不是尝试调参或升级版本。